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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
Data corrente: |
06/08/2009 |
Data da última atualização: |
10/11/2010 |
Autoria: |
BENÍTEZ, C. M. V.; LOPES, H. S. |
Afiliação: |
CÉSAR MANUEL VARGAS BENÍTEZ, CPGEI/UTFPR; HEITOR S. LOPES, CPGEI/UTFPR. |
Título: |
Algoritmo genético aplicado na predição da estrutura de proteínas utilizando o modelo 3D-HP Side Chain. |
Ano de publicação: |
2009 |
Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO, 29., 2009, Bento Gonçalves. Anais... Rio Grande do SUL: Instituto de Informática UFRGS. |
Páginas: |
717-726. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
CSBC 2009. |
Conteúdo: |
Este trabalho apresenta um algoritmo genético paralelo (AGP) para o problema de dobramento de proteínas, utilizando o modelo 3DHP-SC. Este modelo tem sido pouco abordado devido ao elevado grau de complexidade envolvido. Foi proposta uma função de fitness baseada na energia livre e na compacidade do dobramento. Devido a não existir, até então, benchmarks para teste deste modelo, foi proposto um conjunto de 5 sequências baseado em outro modelo mais simplificado. O AGP obteve dobramentos biologicamente coerentes, sugerindo a adequabilidade da metodologia proposta. Trabalhos futuros incluirão a proposição de operadores genéticos baseados em conhecimento, bem como a expansão do benchmark. |
Palavras-Chave: |
3DHP- SC; Algoritmo genético paralelo (AGP); Bioinformática; Dobramento de proteínas; Modelagem computacional. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 01455naa a2200217 a 4500 001 1256506 005 2010-11-10 008 2009 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aBENÍTEZ, C. M. V. 245 $aAlgoritmo genético aplicado na predição da estrutura de proteínas utilizando o modelo 3D-HP Side Chain. 260 $c2009 300 $a717-726. 500 $aCSBC 2009. 520 $aEste trabalho apresenta um algoritmo genético paralelo (AGP) para o problema de dobramento de proteínas, utilizando o modelo 3DHP-SC. Este modelo tem sido pouco abordado devido ao elevado grau de complexidade envolvido. Foi proposta uma função de fitness baseada na energia livre e na compacidade do dobramento. Devido a não existir, até então, benchmarks para teste deste modelo, foi proposto um conjunto de 5 sequências baseado em outro modelo mais simplificado. O AGP obteve dobramentos biologicamente coerentes, sugerindo a adequabilidade da metodologia proposta. Trabalhos futuros incluirão a proposição de operadores genéticos baseados em conhecimento, bem como a expansão do benchmark. 653 $a3DHP- SC 653 $aAlgoritmo genético paralelo (AGP) 653 $aBioinformática 653 $aDobramento de proteínas 653 $aModelagem computacional 700 1 $aLOPES, H. S. 773 $tIn: CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO, 29., 2009, Bento Gonçalves. Anais... Rio Grande do SUL: Instituto de Informática UFRGS.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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